Cómo puedo mejorar el rendimiento de Zimbra

Deshabilitar la capa SSL de seguridad en los procesos internos entre los servidores Zimbra (LDAPS, ...), normalmente es una red interna securizada por un firewall y de esta forma nos ahorramos RAM y proceso de CPU.
zmlocalconfig -e zimbra_require_interprocess_security=0

Heap Size 
Por lo general debe ser entre un 20% y un 30% de la memoria total del servidor. Sin pasarse de 6,4GB.Tener en cuenta que al servidor es preferible ampliar la RAM de Mysql.
Si tenemos 20GB le asignamos 5GB
zmlocalconfig -e mailboxd_java_heap_size=5120
Heap size reserved for classes
por defecto viene definido muy bajo 128 hay que ampliarlo a: 
-XX:PermSize=196m -XX:MaxPermSize=350m

CMS y GC
-XX:+UseConcMarkSweepGC -XX:+UseParNewGC
Uses the concurrent mark sweep collector (CMS) and the parallel new garbage collector (GC) together.

-XX:SoftRefLRUPolicyMSPerMB=1
This option helps evict entries from the caches held by the mailbox server. Not setting this option will result in softly reachable (ie, evictable) cache objects filling up the heap and causing out of memory errors.

Memoria de MySQL
nano /opt/zimbra/conf/my.cnf
#Ampliamos el buffer entre un 25% y un 35% de la memoria RAM total del #servidor
innodb_buffer_pool_size        = 7516192768

#Por defecto innodb_max_dirty_pages_pct = 90 
#Esto guarda muchas transacciones en memoria y cuando lo va 
#a escribir en el disco duro todo el sistema se enlentece. Si lo 
#bajamos al 10% escribe en disco más amenudo pero menos cantidad.
innodb_max_dirty_pages_pct = 10

Configurar DKIM en Zimbra 8

Generar una clave de registro DNS de tipo DKIM para el dominio midominio.es
zimbra@host:/root$ /opt/zimbra/libexec/zmdkimkeyutil -a -d midominio.es
DKIM Data added to LDAP for domain midominio.es with selector 4D23690A-D5CF-11E3-9562-BE9DEF34D14A
Public signature to enter into DNS:
4D23690A-D5CF-11E3-9562-BE9DEF34D14A._domainkey IN      TXT     ( "v=DKIM1; k=rsa; "
          "p=MIGfMA0GCSqG...." )  ; ----- DKIM key 4D23690A-D5CF-11E3-9562-BE9DEF34D14A for midominio.es

Dar de alta en el DNS el registro que nos ha generado el comando anterior:
si usas bind9 el registro dentro de la zona midominio.es sería el siguiente:
4D23690A-D5CF-11E3-9562-BE9DEF34D14A._domainkey.midominio.es.    IN    TXT    "v=DKIM1; g=*; k=rsa; p=MIGfMA0GCSqG...."

Comprobar que se ha creado el registro DNS
nslookup -type=txt 4D23690A-D5CF-11E3-9562-BE9DEF34D14A._domainkey.midominio.es.

Comprobar que el registro DNS para DKIM funciona correctamente
/opt/zimbra/opendkim/sbin/opendkim-testkey -d midominio.es -s 4D23690A-D5CF-11E3-9562-BE9DEF34D14A -x /opt/zimbra/conf/opendkim.conf -vvv

Bibliografía:
http://tipstricks.itmatrix.eu/?p=1587