En ubuntu y debian es muy secillo resetear la contraseña del usuario root del servidor mysql
si somos el usuario root del sistema.
sudo /etc/init.d/mysql stop
sudo mysqld_safe --skip-grant-tables & sudo mysql -u root mysql mysql> UPDATE user SET Password=PASSWORD('nueva_contraseña') WHERE User='root'; mysql> FLUSH PRIVILEGES; mysql> \q
sudo killall mysqld;
sudo /etc/init.d/mysql start
extraido de (guia ubuntu)
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